Derik,
No primeiro momento, monte o XML com as informações apenas do RPS:
<GerarNfseEnvio xmlns="http://www.abrasf.org.br/nfse.xsd">
<Rps>
<InfRps Id="xxx">
.......
</InfRps>
</Rps>
</GerarNfseEnvio>
Assine o XML.
Insira as informações do lote no XML gerado (assinado).
Assine o novo XML.
Abraços,
Miguel Motta